导演：拉娜·沃卓斯基 莉莉·沃卓斯基 

主演：基努·里维斯 劳伦斯·菲什伯恩 凯瑞-安·莫斯 雨果·维文 莫妮卡·贝鲁奇 赫尔穆特·巴凯蒂斯 斯蒂夫·巴什托尼 克里斯汀·阿努 丹尼尔·伯哈特 约瑟芬·白内斯 安迪·阿尼斯 贾达·萍克·史密斯 邹兆龙 埃茜·戴维斯 纳许·埃哲顿 格洛丽亚·福斯特 大卫·富兰克林 诺娜·加耶 小罗伊·琼斯 大卫·基尔德 兰德尔·杜克·金 克里斯托弗·卡比 纳撒尼尔·利斯 哈里·列尼斯 罗伯特·马莫内 马特·麦科姆 罗宾·奈文 大卫·诺 吉娜薇·欧瑞丽 苏格拉底·奥图 哈罗德·佩里诺 阿德里安·雷梅特 尼尔·雷梅特 

上一部结尾，尼奥（基奴李维斯饰）终于意识到自己的能力和使命，中弹复活后，变成了无所不能的“救世主”，他和女友崔妮蒂（凯莉·安·摩丝饰），舰长墨菲斯（劳伦斯·菲什伯恩饰）回到了人类的基地锡安，受到人们的热烈欢迎。此时，“母体”决定先下手为强，派出了两万五千只电子乌贼攻击锡安基地；墨菲斯、尼奥和崔妮蒂则再次进入“母体”，寻找“制钥者”，准备从内部破坏；而本该被尼奥消灭的特勤史密斯似乎出了点问题，脱离了“母体”的控制，拥有可怕的复制能力，阻碍尼奥他们的行动。